PCT國際申請包括兩個階段：國際階段與國家階段。（1）在中國提交PCT國際申請（即國際階段）大致分為以下步驟：
1． 提出申請。申請人可以在中國在先申請的申請日（優(yōu)先權(quán)日）起12個月內(nèi)以中文向中國國家知識產(chǎn)權(quán)局提出PCT國際申請，并要求中國的優(yōu)先權(quán)，無需提交優(yōu)先權(quán)證明文件。
2． 中國國家知識產(chǎn)權(quán)局作為受理局受理專利申請，并作為國際檢索單位出據(jù)國際檢索報告。申請人可根據(jù)以上的檢索報告，對其專利申請文件進行修改。
3． 國際公布專利申請。國際局將于自優(yōu)先權(quán)日起滿18個月即行公布。
4． 提出國際初步審查請求。申請人應(yīng)在申請同時或在自優(yōu)先權(quán)日起19個月內(nèi)提出國際初審請求，并交納審查費。
5． 國際初審單位出據(jù)國際初審報告，申請人可根據(jù)該報告對其專利申請文件進行修改。 （2） PCT途徑進入國家階段：
申請人可在自優(yōu)先權(quán)日起30/31個月屆滿前選擇PCT成員國，并向該國專利局申請其國家專利，即：進入該國的國家階段。PCT國際申請進入國家階段時，須要將申請文件翻譯為申請國的官方語言，其主要程序與在國內(nèi)申請專利相同，即包括：申請進入、公布、實質(zhì)審查、授權(quán)等程序。對于實用新型，大多數(shù)國家無須實質(zhì)審查即可授權(quán)；有些國家沒有實用新型專利，如：美國、加拿大、英國等，在這些國家只能申請發(fā)明專利。雖然國家階段的費用與單獨在各個國家申請國家專利的費用差不多，但是其優(yōu)點是可以將優(yōu)先權(quán)期限從12個月延長到30/31個月向其成員國申請國家專利，使申請人有更多的時間來決定進入哪些國家申請相同主題的專利，并根據(jù)檢索報告和初審報告修改專利申請文件，以滿足發(fā)明創(chuàng)造的新穎性、創(chuàng)造性和專利性。
完成進入不同國家的國家階段的工作后，申請人則擁有不同國家的專利，他們相互獨立，每一項都需要繳納年費。申請人一般需提前2～3個月確定進入哪些國家的國家階段，并委托涉外代理機構(gòu)啟動翻譯和文件準備工作。在與知識產(chǎn)權(quán)代理公司簽訂代理合同并支付合同約定的費用后，即可進入申請程序。